L'Isola di Montecristo è una Riserva naturale, inserita dal 1977 nella Rete Europea delle Riserve Biogenetiche. Dal 1988 è stata istituita una zona di tutela biologica intorno all’isola, per una estensione di mille metri dalla costa. Il piccolo Museo naturalistico illustra gli elementi caratteristici della flora e della fauna presenti sull’Isola e nei fondali marini circostanti; dispone anche di un acquario.