L'Orto Botanico di Napoli, istituito da Giuseppe Bonaparte nel 1807, ospita circa 25.000 esemplari provenienti da ogni parte del mondo. Le piante sono raggruppate in aree distintesecondo tre criteri: ecologico, sistematico ed etnobotanico. Nelle aree a carattere ecologico sono state ricreate condizioni ambientali simili a quelle presenti in natura, come ad esempio per l'area che riproduce l'ambiente della macchia mediterranea, o per le vasche che ospitano le piante acquaticheo. L'area delle Pinophyta, l'area delle Magnoliophyta, l'agrumeto e il palmeto sono invece zone a carattere sistematico, dove sono raggruppate piante affini secondo criteri classificatori. La Sezione Sperimentale delle piante officinali ha invece carattere etnobotanico, e infatti vi sono coltivate specie utilizzate dall'uomo per scopi vari, raggruppate secondo il tipo di applicazione. All'interno dell'Orto è anche il Museo di Paleobotanica e Etnobotanica. Nella sezione dedicata alla Paleobotanica sono presentati reperti fossili che, con l'aiuto di un albero filogenetico tridimensionale, testimoniano l'evoluzione delle piante terrestri dal Siluriano (circa 400 milioni di anni fa) ai nostri giorni.Nella sezione di Etnobotanica sono presentati oggetti provenienti da Filippine, Borneo, Sumatra, Amazzonia e Messico che sono disposti in vetrine tematiche ispirate alle varie attività quotidiane delle popolazioni indigene di queste aree.