Il Museo espone collezioni scientifiche e collezioni didattiche raccolte a partire dal 1876. Molto belle le collezioni di farfalle e di insetti giganti provenienti da tutto il mondo. Il Museo è intitolato a Filippo Silvestri, uno dei padri dell'entomologia italiana; tra i primi ebbe l'intuizione di studiare gli insetti dannosi in agricoltura assieme agli organismi che ne contrastano lo sviluppo. Di Silvestri è la cosiddetta 'Collezione Biologica', realizzata 'disponendo in scatole separate, con coperchio di vetro, esemplari di ciascun insetto, in tutti gli stadi a partire dall'uovo, insieme a foglie o parti di frutti e di rami, mostranti i guasti caratteristici da esso prodotti, nonché esemplari degli insetti riconosciuti di esso parassiti' (Filippo Silvestri, 1928). In questo modo gli insetti sono ancora esposti. Dell'entomologo il Museo conserva anche lo studio, completo degli strumenti che usava per la cattura e lo studio degli insetti.