I casi nel quale il lettore si è trovato sono due:

1. ha messo le bottiglie in acqua calda (spero bollente) dopo averle tappate

2. oppure le ha tappate subito dopo averle portate ad alta temperatura

Nel primo caso (così si capisce dalla domanda) le bottiglie dovrebbero essersi incrinate per il forte aumento di pressione che si è avuto all'interno (mi aspetto che siano esplose anche subito). In realtà non si fà così, non si capisce perché dovrei sterilizzare l'esterno della bottiglia...
Il secondo caso invece descrive la procedura che si segue in realtà. Lo scopo non è quello di sterilizzare ma di creare una depressione all'interno dopo che le bottiglie saranno tornate a temperatura ambiente; in tal modo la quantità di aria presente all'interno della bottiglia è molto piccola ed è questo che rallenta, fino quasi a eliminarlo, l'eventuale processo di fermentazione. E' chiaro che, affinché questa procedura abbia successo, il tappo con cui si "sigilla" la bottiglia subito dopo averla portata ad alta temperatura deve essere a tenuta stagna, altrimenti l'aria entra durante il raffreddamento; se il tappo non è deformabile, la pressione all'interno è minore e quindi la bottiglia è soggetta a una pressione esterna dell'ordine di un mezzo kilo al centimetro quadrato, quindi non piccola. Attenzione al tipo di bottiglie usate!!! Quelle normali potrebbero non sostenere lo sforzo.
In entrambe i casi la bottiglia con tappo poco deformabile è soggetta a un discreto sforzo perché la differenza di pressione interno-esterno, è circa la stessa anche se con segno opposto nei due casi.