Il biodiesel si produce facendo reagire nove parti di olio con una parte di metanolo (eventualmente altri alcoli). Si ottengono nove parti di biodiesel e una di glicerina in soluzione acquosa; non ci sono altri residui, tutt'al più ci può essere qualche impurità da eliminare con filtraggio.
La glicerina può essere venduta dopo semplice concentrazione (eliminando l'acqua dalla soluzione) oppure può essere portata a livelli di raffinazione più elevati spuntando migliori prezzi di mercato. In ogni caso la destinazione è il mercato cosmetico-farmaceutico.