La domanda pone l'accento su un'apparente contraddizione. Da un lato, il DNA è il materiale ereditario, che codifica la sintesi delle proteine, ossia dà le istruzioni per produrre le proteine. Dal momento che le proteine sono essenziali per la cellula e determinano tutte le caratteristiche della cellula, esse, in prima approssimazione, devono essere uguali in tutti gli individui. Se una proteina fosse diversa da individuo a individuo, si avrebbero i cosiddetti mutanti con conseguenze molto gravi, in quanto insorgerebbero le malattie ereditarie. È quindi atteso che il DNA, proprio in quanto codificante le proteine, sia stabile e non vada incontro a diversità da individuo a individuo. La risposta alla domanda “se anche le proteine sono diverse da un individuo all'altro (per esempio, il fibrinogeno di una persona è diverso da quello di un'altra?)” è no.

D'altro canto, è stato osservato che il DNA è diverso da individuo a individuo (in media due individui differiscono tra loro per una base ogni 500 nucleotidi). Questa diversità è sfruttata, tra l'altro, in medicina legale per tipizzare gli individui effettuando il cosiddetto fingerprinting molecolare.

Il DNA è quindi sia uguale sia diverso da individuo a individuo. Come conciliare questa contraddizione? La risposta deriva dal fatto che non tutto il DNA codifica proteine. Il DNA codificante costituisce infatti solo circa il 2% del DNA totale. La rimanente parte del DNA, ossia circa il 98%, non codifica proteine e non si sa che funzione abbia. Uno dei temi di ricerca attuali è appunto lo studio del significato del DNA non codificante, ammesso che ne abbia uno. Quindi, il DNA codificante proteine deve essere stabile e non subire variazioni di sequenza nucleotidica, mentre il DNA non codificante può andare incontro a diversità, senza che questo si rifletta sulle proteine.