L'acqua si muove nelle rocce in due modi. Utilizzando la permeabilità di poro, oppure utilizzando la permeabilità per fratturazione. I pori di rocce granitiche o metamorfiche, quali le rocce delle alpi interne, sono molto ridotti (possono costituire l'1% o meno della roccia totale) e non servono al passaggio di acqua. Tuttavia le fratture costituiscono in queste rocce un condotto molto efficace al trasporto di fluidi. L'acqua si incanala e il flusso si concentra.

Si instaurano celle convettive di fluidi che penetrano dall'alto e percolano verso il basso dove si riscaldano per poi risalire verso al superficie. Coprire un dislivello di 2 km non è un problema. Bisogna anche pensare che con un gradiente termico medio di 30 - 50 gradi centigradi per chilometro, non ci vuole molto a riscaldare acqua nelle viscere della Terra. Le aree termali sono ubicate dove esistono canali preferenziali, per fratturazione, lungo faglie, utilizzati dall'acqua per risalire.